汇总：机器学习常用数据库、软件及下载链接

NCBI []

NCBI (National Center for Biotechnology Information）是所称美国政府国立生器皿技术教育培训

EMBL []

欧洲分子会生器皿学试验中室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）

DDBJ []

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年构建，是世界三大DNA 信息库系统之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI信息库系统携手组成国际DNA信息库系统

CNGB []

近现代第三世界信息库系统（China National GeneBank）坐落深圳市白鹤一新区，是继世界三大信息库系统之后的亚洲地区第四大第三世界级信息库系统。它是近现代首个，也是唯一一个第三世界锡因组库，一般而言亚洲地区另外三个锡因组库而言，第三世界锡因组库样品完好的规模、存储量和可访问的信息量皆是亚洲地区较大。

BIGD []

近现代第三世界锡因组组科学研究教育培训 生命与心理健康大教育培训 (National Genomics Data Center BIG Data Center)

miRBase []

piRNAbank []

piRNAbank []

SILVA []

LncRNAdb []

真核生器皿

LncRNAwiki [_Page]

人类长非编码器RNA信息库系统

Rfam[]

类似于Pfam的RNA家的族编者信息库系统

Human protein atlas [ ]

化学物质亚锡在细胞内、组织、病理条件下的表示

Pfam []

Pfam是亚锡质家的族的信息库系统，包括使用自生解是三维生成的编者和多锡因组鉴别。

SwissProt []

手动编者的非冗余亚锡锡因组信息库系统

UniProt [ ]

PIR []

Antibodies []

BRENDA [ ]

HPRD []

InterPro []

通过联结多个亚锡具体信息库系统，提供了一个方便的对亚锡锡因组开展机制编者的平台，包括对亚锡质家的族、糖蛋白、机制亚锡的数据分析

iProClass []

PRF []

REBASE []

PDB []

通过试验中测实有的构件

SCOP []

CATH []

PSI []

PROSITE []

最全面

Pfam []

最专业

ProDom []

CCD []

Prints []

SMART [ ]

TIGRFAM []

STRING []

DIP []

试验中证明的亚锡化学键信息库系统

BioGRID [] ：

IntAct [ ]

MapMan：一个机制强大的代谢必需查看和主笔软件

KEGG []

GO []

NCBI BioSystems []

IMP []

plantCyc []

MANET [ ]

MetaNetX [ ]

MataboLights []

HMDB []

YMDB []

ECMDB []

Planteome []

dbGaP []

IPPN []

GeneCard []

Gene Wiki[_Wiki ]

Blast []

Interproscan []，

WEGO []

KAAS []

FGENESH []

AUGUSTUS [ ]

GENESCAN []

GeneMark []

Glimmer []

Exon-Intron Graphic Maker []

根据候选锡因组的外显子和外显子等信息绘成锡因组构件

Blastp [_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome]

可的网站获取亚锡糖蛋白的编者和左边信息

ArrayExpress [ ]

信息来自EMBL的高通量机制锡因组组学试验中的信息；

BAR []

在研究锡因组机制时，上会会参考锡因组的表示模式，即锡因组在植器皿各有不同组织各有不同发育中期的表示轻元素变动。通过的网站研究FacebookBAR对候锡因组开展表示研究。 是一个植器皿生信研究自然资源Facebook，用该Facebook研究锡因组表示时，不仅可以给予锡因组表示模式的热图，还可以给予可视化的电子激光幻灯片，直观呈现锡因组在植器皿组织中的表示左边。

GSDS []

Gene Structure Display Server，锡于锡因组组编者文件绘成锡因组锡因组构件等机制

ProtParam []

亚锡连续性研究是所称亚锡的一些器皿理和化学参数，如分子会量、等电点、和原子组成、消光系数、同位素、不稳实有系数、脂肪的族所称数、亲潮有数带。这些参数，有助于开展亚锡的具体有机体试验中。比如在体内基本概念（大肠杆霉、酵母菌等）表示和纯化目标亚锡时，所需重新考虑亚锡的分子会量、等电点、消光系数、不稳实有系数和亲潮有数带等。在蛋白已逝试验中中，也所需根据这些参数提高效率试验中基本概念。

Protscale []

亚锡的长幼潮有数带主要由其侧碱基锡团R，如果R只是H或是C、H两元素组成的话，都是亲水性的，如果含有亲水性侧碱基锡团，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是亲水性的（亲水的）。神宗潮有数带有嘧啶、胺基酸、苯丙氨酸、组氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、丙氨酸和蛋氨酸（赖氨酸）。神宗潮有数带在亚锡质内部，在保有亚锡质的三级构件上，蛋白和锡质、抗体和抗原有数的化学键等各种非共价键的分子会联结方面，具有重要作用。

TMHMM []

亚锡的地区性腹腔构件研究对于数据分析亚锡的亚细胞内有别于密切具体。如果具有地区性腹腔构件，亚锡很或许实有坐落细胞内中与腹腔具体的构件，如细胞内质腹腔、叶绿体腹腔或真核海洋生物腹腔等内腹腔系统。此外，亚锡地区性腹腔构件研究对于亚锡机制研究也有一实有的希望。比如某亚锡没有人地区性腹腔构件，但是亚细胞内有别于试验中显示其可实有坐落腹腔具体构件，这说明该亚锡或许通过其他腹腔有别于亚锡招募过去的。

SignalP []

峰接收机左边为接收机肽切割点，峰之后的锡因组为接收机肽

接收机肽是所称随时随地一新还原的亚锡质向肠道通路移转到的短肽碱基，；也坐落亚锡的N-末端，负责把亚锡质随时随地到各有不同腹腔构件的亚细胞内器内。编码器肠道亚锡的mRNA在中文翻译时首先还原N末端的接收机肽，它被接收机肽标记亚锡(SRP)所标记，SRP将核酸运载至线粒体上，线粒体腹腔上的 SPR 细胞内因子标记并与之联结。一新还原亚锡在接收机肽随时随地下到达线粒体内腔，而接收机肽则在接收机肽蛋白的作用下被切除术。由于它的随时随地，一新生的就必须通过线粒体腹腔带入腔内，就此被肠道到胞外。在宿主霉中表示经年累月亚锡时，需用接收机肽随时随地经年累月亚锡有别于肠道到胞外，更高亚锡可溶性，在核糖表示系统（大肠杆霉、变形虫杆霉等）和真核表示系统（如毕故称酵母菌）中均有应用。

NetPhos []

KinasePhos-2.0 []

亚锡质一氧化氮所称由亚锡质激蛋白催化的把 ATP 的磷酸锡移转到到底器皿亚锡质残锡（丝氨酸、苏氨酸、嘧啶）上的更进一步，或者在接收机作用下联结 GTP（上会以 GTP 取代 GDP），是生器皿体内一种都是的恒定方式，在细胞内细胞内器的更进一步中起重要作用。在接收机远超时通过给予一个或几个磷酸母公司而被激已逝，而在接收机减弱都能掺入这些母公司，从而失去已逝性。有时某个接收机亚锡一氧化氮上会造成下游的亚锡共五牵涉到一氧化氮，过渡到一氧化氮级联加成。

二、生器皿信息学软件及串流文档：

Clustal:

MEGA:

MAFFT:

Sequence Matrix:

PGDSpider:

DnaSP v6:

Arlequin:

MapMan：

PartitionFinder:

jModelTest:

IQ-TREE:

IQ-TREE的网站:

RaxmlGUI:

Mrbayes 3.2.7:

PhyloSuite:

BEAST:

Figtree:

Tracer:

PopART:

Network:

Structure:

CLUMMP:

Distruct:

Migrate-N:

Phylonet: 或