Cell | 建立本能树突状细胞与辅助性T细胞相互作用模型

细胞膜-细胞膜相互效用异常有用，涵盖大量小分子与频率路中的，学界修习多年，仍旧是管中的窥豹。来自阿姆斯特丹PSL科学研究大学的Vassili Soumelis团队于在Cell月刊上发表文章篇名A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的篇文章，创建了物理与观点相结合的科学研究工具，物理上，在蛋白质技术水平扫描了细胞膜所分泌物的细胞膜因子与应激反应；某种程度，创建了频率输入反向相互间的联系和相互效用的关系。所作以生物树突椭圆形细胞膜（Dendritic cell，又称DC）与发挥作用T细胞膜（T Helper cell，又称Th）相互间的相互效用为科学研究实例，统计分析了36唯DC无关的频率小分子和17种Th分泌物的细胞膜因子，并依靠这些图表创建数学三维，演算出56种已经被物理得出结论的细胞膜相互的关系，与此同时，还推断出出290种可能的关系，并得出结论了IL-12p70可以通过IL-1频率路中的可借17型发挥作用T细胞膜（又称Th17）。首先，所作挖掘出了生物单核细胞膜比如说的DC（MoDCs）和外周肝脏CD11c+DC（bDCs）两类细胞膜，并抑制24星期。所采行的抑制频率主要包含三大类多达14种。第一种：内源频率小分子，除此以外干扰素beta（interferon β，又称IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll样抗原的配基，除此以外Toll4抗原的-HT脂多糖（ lipopolysaccharide，又称LPS），Toll1/2抗原-HTPAM3CSK4，Dectin1-HTCurdlan，Toll2/Dectin1-HT zymosan，Toll7/8抗原-HTR848，Toll3抗原-HT poly(I：C) 和NLRP3炎症小体活化剂铝钾；第三种：细菌病毒，除此以外干燥灭活的Candida albicans （又称HKCA），西汉姆联菌（Listeria monocytogenes，又称HKLM），Staphylococcus aureus （又称HKSA）， Streptococcus pneumoniae （又称HKSP）和肝炎病毒（influenza virus，又称flu）。每一次，所作通过流式细胞膜拳法等工具，扫描了36种DC无关小分子的表达出来情况，其中的，29种处于细胞膜凹凸不平，7种处于细胞膜分泌物上清代之中的。结果显示，除了一些目前为止的DC细胞膜拥护均，所作还有了一些在此之后推断出：（1）zymosan抑制的MoDCs 表达出来高技术水平的CD54 和PVR；（2）肝炎病毒抑制的MoDCs可以可借ICOSL；（3）LPS抑制的MoDCs 可以可借高技术水平的CD30L和CD83。再下来，所作将这些抑制过的DC与T细胞膜粗略估计6天，随后扫描Th的增殖效率以及17种Th无关细胞膜因子的表达出来分泌物情况。寻常的是，所作将Th和DC的乏善可陈相互比较，推断出，这二者相互间却是存在集合的的关系，却是一定，两种抑制物对DC激发的精准度类似，但是，这两种抑制物所妥善处理的DC与T细胞膜粗略估计之后，激发的精准度很可以截然却是相同。接着，所作采行分布式计算的工具，以上述物理图表创建三维。简单来说，所作综合DC反向的36种频率小分子和Th反向的17种效应小分子，将两两相互间的的关系简化为“更进一步管控”和“对人管控”两种，并且，还重新加入图表库和已发表文章史料中的的信息，创建了有用的频率管控因特网。唯如，通过这一三维，所作推断出， IL-10的对人管控小分子除此以外OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而更进一步管控小分子除此以外Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这样，给予DC却是相同的抑制频率，所作就可以可知Th拥护细胞膜IL-10的表达出来分泌物情况。最后，所作利用这样三维，试示意图推断出并得出结论在此之后细胞膜相互的关系。通过创建的三维，所作推断出，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2携手分泌物时，保守于管控IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 携手显现出时，则来得保守于管控IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的表达出来技术水平都显着降低。这些结果说明，IL-12策划Th17的可借分化。为了进一步阐述IL-12可借Th17的功能，所作采行体外可借Th的三维，推断出，IL-12并很难直接可借Th17，但是，同时重新加入IL-1和IL-12，Th17就可借出来了。这是一篇物理与观点相结合的佳作。物理结果与计算出来动态相互支持，相互监督，总括。如下示意图所示，物理以外采行了密切联系两以外图表，一是何种抑制下DC细胞膜的拥护，二是拥护后的DC对T细胞膜的效用。观点以外以DC和T细胞膜的反向细胞膜因子为核心，创建了细胞膜因子相互间的更进一步和对人管控因特网三维。通过这一三维，所作举例来说一些在此之后细胞膜间相互的关系，最终再用物理得出结论这些的关系是否断定。这篇篇文章的亮点有两处，一是创建和物理观点相结合科学研究的范本，二是篇文章中的给予的诸多细胞膜管控信息以供科学研究参考。许多现代引自：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.