Lancet Oncol:肾透明细胞癌与肥胖悖论无关的转录组特征分析

2021-12-13 02:33:52 来源:
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一.数据分析背景

老年人与膀胱光亮蛋白胰脏 (ccRCC)的效用上升有关,但老年人又冲突地与该的预后有所改善有关,其潜在机制尚不具体。附属作者对老年人高血压和但会身高高血压在原发和肿周脂质两其组织中会的心肌分解成和免疫调控两组相似之处进行数据分析比对。

本文介绍了遗传物质详见达引起的微环境的相似之处有助于解释老年人高血压的适应环境优势(老年人假设)。

二.比对流程三.文中讲解1.COMPARZ函数调用、TCGA-KIRC函数调用、MSK免疫疗法函数调用数据集收集、牙科

在COMPARZ函数调用的453名高血压中会,有375名(83%)高血压带有可用的单链数据集,疗法前BMI测量以及无进展和整体而言适应环境数据集进行比对(详见1)。除119名(26%)太重高血压部份,来自COMPARZ飞行测试的最终函数调用还包括256名(68%)高血压(n=256)。

详见1.COMPARZ针灸飞行测试函数调用的人口数统计分析和针灸形态

TCGA-KIRC函数调用中会的332事例高血压中会,指标了经膀胱切除术疗法的152事例(46%)中后期(即AJCC III和IV期)ccRCC高血压的针灸和人口数统计分析数据集(详见2)。在排除59名(39%)太重高血压后,最后获得的函数调用还包括93名高血压(n=93)。

详见2.中后期光亮蛋白膀胱蛋白胰脏TCGA-KIRC函数调用的人口数学和针灸形态

从62事例MSK远处脂质两其组织函数调用中会进行膀胱脏切除术的非乳腺癌光亮蛋白RCC高血压中会获得了原发性和远处脂质样品。在这个函数调用中会,从59名高血压的PNN(膀胱周不远处)远处脂质,25名高血压的PNA(远离膀胱周)远处脂质以及55名高血压的两其组织中会样本。在排除太重高血压之后,最终函数调用还包括41名(69%)PNN采样高血压, PNA采样为17(68%),采样为37(67%)。从最初的203名举例来说的MSK免疫疗法数据分析人群集中会排除74名(36%)太重高血压后,总适应环境比对的最终函数调用还包括129名(64%)举例来说(详见3)(n=129)。

详见3. 采用MSK免疫疗法的针灸飞行测试函数调用的人口数统计分析和针灸形态

2.老年人的膀胱光亮蛋白胰脏高血压相对于但会身高的膀胱光亮蛋白胰脏高血压总适应环境期较短

根据KM适应环境比对,在三两组中会都发附属老年人高血压的总适应环境期较短。在TCGA-KIRC函数调用中会,经分期修正后,老年人高血压的整体而言存活期尤精但会身高两组;在COMPARZ函数调用中会,经IMDC效用高分修正后,大人高血压的整体而言存活期也尤精但会身高两组。在MSK免疫疗法函数调用中会,经IMDC效用高分修正后,BMI与死亡率的无特别是在相似之处(如布1)。

布1.TCGA-KIRC函数调用 (A)、COMPARZ 函数调用(B)和MSK免疫疗法函数调用(C)的总适应环境期

3.COMPARZ函数调用中会老年人高血压带有更佳的PFS

对CPMPARZ函数调用KM比对后,KM双曲线结果显示,COMPARZ函数调用中会老年人高血压比但会身高高血压带有更佳的PFS。

布S1.COMPARZ函数调用中会老年人高血压比但会身高高血压带有更佳的PFS

4.运用于一线药物疗法,老年人高血压仍带有更佳的OS

KM双曲线结果显示了在运用于一线半胱氨酸嘌呤相异物(pazopanib或Sunitinib)的两个疗法两组中会,老年人高血压的OS仍然较但会身高高血压好。

布S2.COMPARZ函数调用运用于一线药物疗法两组的总适应环境期比对

5.COMPARZ函数调用中会,老年人与但会身高的高血压调控两组遗传物质形态存在特别是在相似之处

认真完上述比对,作者在三个函数调用中会断定老年人假设存在之后,接下来在COMPARZ函数调用中会对老年人和但会身高高血压指标了调控两组学相似之处。先是认真了Hallmark遗传物质集的GSEA比对,相比较老年人高血压与但会身高高血压相互有数的相似之处:老年人高血压中会结果显示缺氧、TGF-β、上皮细胞-有数充质转变和心肌分解成频谱移动式特别是在下调,预设伤口脊柱必需的激活(布A)。布B是对布A审核的几个遗传物质详见达移动式的Enrichment plots。

布S4.COMPARZ函数调用中会老年人高血压与但会身高高血压的ccRCC调控两组遗传物质形态存在特别是在相似之处

6.COMPARZ函数调用与TCGA-KIRC函数调用 中会老年人比但会身高高血压的心肌分解成高分高

在GESA相异的形态遗传物质集心肌分解成高分相比较中会,老年人高血压略低于但会身高高血压(如布2)。

布2.COMPARZ函数调用(A)与TCGA-KIRC函数调用 (B)中会老年人原发高血压与但会身高高血压的心肌分解成的z score

7.但会身高与老年人高血压的免疫蛋白群集无特别是在相似之处

对但会身高(7事例)与老年人(16事例)高血压的原发的主要免疫蛋白数量外采用流式蛋白术进行指标。布A结果显示了老年人高血压与但会高血压相互有数的免疫蛋白群集的整体而言相似之处。布B具体结果显示了老年人和但会身高高血压T蛋白群集的灌注技术水平。发附属但会身高与老年人高血压的免疫蛋白群集无微小相似之处,免疫蛋白灌注的程度与BMI相关联。

布S9.用流式蛋白术比对但会身高与老年人高血压的免疫蛋白群集无微小相似之处

8.与但会身高高血压相对,老年人高血压肿周脂质两其组织黏膜上升,特别是不远处的肿周脂质

在MSK的非乳腺癌ccRCC高血压的前瞻性函数调用中会,作者合并了20个最特别是在的多样的IPA约束移动式,这些移动式来自于老年人和但会身高高血压的PNN和PNA采样的相比较(布A)。老年人和但会身高高血压的PNN和PNA采样相互有数的免疫灌注(ssGSEA高分)相比较(布B)。

布S5.与但会身高的高血压相对,老年人高血压的膀胱周脂质结果显示出新黏膜和缺氧上升

综上,在COMPARZ飞行测试函数调用中会,经过IMDC效用高分更改后,发附属相对于但会身高高血压,半胱氨酸嘌呤相异物疗法提高了老年人高血压的适应环境率,特别是不感兴趣sunitinib疗法的高血压。IMDC效用高分模型包含的两糖类有数接反映宿主主因对胰脏症有系统黏膜发挥作用(事例如病变,中会性粒蛋白升高,和血栓升高症),这些主因显然也是免疫疗法结果和BMI相互有数关连性机制的因素。发附属老年人高血压的心肌分解成最高分略低于但会身高高血压,与之前其他的数据分析结果详见明的,参与心肌分解成,β-氧必需等等遗传物质的富集的附属象相符。因此,心肌分解成的相似之处可以部分解释老年人高血压不感兴趣半胱氨酸嘌呤相异物疗法后的较好预后。

此数据分析为老年人假设提供了生物学支持。在患有ccRCC的高血压观察到老年人高血压相对于但会身高的高血压微环境的相似之处:特别是老年人高血压的的心肌分解成上升,但整体而言黏膜无微小相似之处。相比较的是老年人高血压的远处脂质结果显示上升的黏膜和缺氧因素。光亮蛋白胰脏与肿周脂质两其组织微环境的复杂相互发挥作用显然带有针灸意义,有一点进一步数据分析。

原始出新处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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