Nat Biotechnol:研究不能重复?可能会是HeLa细胞系“变”了

2021-11-29 03:07:33 来源:
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HeLa线粒锥体不太可能在世界各地的许多科学物理培育出了近70年,并且长期以来被认为是无限储备的不变的非常相同线粒锥体。然而,2月底18日发表在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新深入研究表明,线粒锥体在非常相同科学物理错综复杂普遍存在相当大差别,这引发了对线粒锥体另有深入研究重复应用于性的质疑。“我很高兴看到这项深入研究,但在某种意义上我非常感到惊讶,”斯隆凯特琳癌症之前心的分子生物学家Prasad Jallepalli说,他从未进行这项深入研究。这非常是HeLa线粒锥体另有自面世以来第一次显现出多样化的报道:多年来,其他深入研究小组也显然了HeLa线粒锥体表征锥体错综复杂在基因组和RNA解读的显着差别。这项月所深入研究首次全面分析了各种HeLa表征锥体的遗传表征(非常相同批次的HeLa线粒锥体另有穷困在世界各地的各个科学物理),并且首次显然遗传关联性导致了细胞内解读和表型的推移。HeLa线粒锥体“变了”?在这项深入研究之前,深入研究其他部门从6个国家的13个科学物理收集了14份HeLa结果显示,并在非常相同的科学物理有条件下进行培育出。他们首先量化了基因拷贝数表征,探究了它们遗传物质错综复杂的显着差别。结果发现,HeLa表征锥体错综复杂,特别是CCL2和Kyoto表征锥体错综复杂普遍存在着巨大的关联性。必要性的推断,许多这些遗传差别再生为mRNA造成了的推移,并且在较小程度上再生为细胞内重元素的推移。深入研究其他部门报告说,HeLa CCL2和Kyoto线粒锥体另有的转录组和细胞内组谱彼此错综复杂的差别,就像来自两种非常相同类型组织的癌线粒锥体另有错综复杂的差别一样。HeLa表征锥体在培育出过程之前栖息于更是快也非常相同,一些线粒锥体群需要17.5星期才能翻倍,而另一些线粒锥体在非常相同的培育出有条件下需要话费超过32星期。它们对病毒性受到感染的反应也有所非常相同:与其他两种专有名词远比,一种专有名词对受到感染的敏感性较低,深入研究其他部门将其归因于低水平的细胞内复合物,这种细胞内复合物在菌株进入寄生物线粒锥体之前起功用。在一项单独的物理之前,深入研究小组通过培育出线粒锥体另有三个月底,来观察HeLa表征锥体的表观是否会随着时间发生推移。深入研究其他部门纪录了中期线粒锥体和更早线粒锥体错综复杂表观差别大约6%。苏黎世联邦分校分子另有统生物学深入研究院的Ruedi Aebersell博士是该深入研究的合着者,他说,“即使在同一个科学物理里面,这些线粒锥体的差别和推移更是快也是非常无与伦比的。”他估计,如果一个深入本科生在项目开始时用HeLa线粒锥体另有做了一个物理,并在六个月底后被要求重复应用于这个物理,他们有可能获取非常相同的结果。关于深入研究之前的“可复制性经济危机”的讨论大多数集之前在物理设计、数据分析方面的毛病,以及作为主要驱动原因的受废料或贴有错首页的线粒锥体另有。但是Aebersell认为,HeLa线粒锥体另有和癌线粒锥体另有的生物学差别可能是关键。为什么会“变”?斯坦福大学的线粒锥体生物学家Tim Stearns认为有几个可能的原因可以说明了为什么线粒锥体另有在长时间培育出下会发生推移。首先,HeLa线粒锥体是可知遗传物质周期性癌线粒锥体,因此很可能随时间随机突变。此外,它们还会在科学物理之前受到各种栖息于有条件的因素,这有可能促使线粒锥体变异出独有的特征。例如,他说,哺乳动物线粒锥体的培育出包括将其培育出到展现一个培育出皿为止,从培育出皿之前抽取一部分线粒锥体,然后将它们置放另一个培育出皿之前栖息于,这一过程称做分裂。“每个人做这件事的方式将都有点非常相同,”他确信。月所这些发现,对于生命培育出线粒锥体的深入研究结果的说明了和重演性有一定的意义。Aebersell和他的同事在论文之前提出了几个具锥体的解决方案。首先,深入研究其他部门应该应用于癌线粒锥体另有的中期传代,并前提在同一线粒锥体另有的非常相同结果显示之前重复应用于同一线粒锥体另有的物理。更是重要的是,生物学家应该清楚地报告他们在任意的深入研究之前应用于的线粒锥体另有表征锥体。
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